Identifiers and Description
Gene Model Identifier
Contig5826.g6244Standard Name
RDRP2 (RNA-directed RNA polymerase 2)Aliases
NoneDescription
RNA-directed RNA polymerase 2Genome Browser
Gene Ontology Annotations
No Data fetched for Gene Ontology Annotations
Domains
No Data fetched for Domains
Homologs
No Data fetched for Homologs
General Information
No Data fetched for General Information
Associated Literature
No Data fetched for Associated Literature
Sequences
>Contig5826.g6244(coding)
atggaaaattcaaaccctaataaatacaataccaaagaatcacctcaacctagaatgaag
agatctagatcgtactgcaaggtatactctcctgtcgctaatcattaaatatagttaata
ccttaaattgggactgaaaatttggtacctccacttgtgttctcccctggtaaaactgat
gaggcaaatttgaagttgcttagtcctaaggataactcagcaacaatgtatacaaaaccc
cacgttgataaccaataataaagatagattgatacctcgagcaataatgaaaaagaaaag
aatacaaagtacatgttcgacattgttagtgacattattcacttctaagttggcactatt
atgtacactaaaatcaaatcagatcactaaaaggagaataaaaaaagattcatacccata
ttccctttcttatatgaggatactaattaaggccacaatgttaacaattgctagttttaa
atgccgaatccacctaaagcatttattaataatggtaatgctaattttatatcatcagaa
attactaatgacaactatgctgacctgaaaaatgaaattaatcagcaaaagcaagaagaa
gagaagaaaaattctaaaatccccacttcagatattccttttaaatgccagctgagattt
taagtagaaaaagacccatttttcatgcatgaggagtctcgcagcactaagattaaagct
cataaaaagatattggagagtgaaaacccctctcctatatacattgtagatttagaattc
acaaacatcaagaagattgagatctttttgaaggaaaaaaaactttaaggaggtctctat
gcagagatatatgtacacatggataagccagcgaactgccagaaactttatccatttaat
taaatgaaaccttgctttgtgagatctccttttaaacttccttttgacccttacatgcaa
tattggaatttgcatcaaatttattttatagctgggaaagtaaccaactagaaaatcgat
aaatttcttgagattgtctagaaaagaaatgctttggtaaaagtcaaaataactaaataa
gattacagtgaggaaactaacaacgatgctaagagatctataatagtctctggactcaga
acattaatagaattgaacaagaagttcaagtatattattgataaactcagactgccgata
atattctcgatgatggcaatgctttcaaatgacaaagttaatttgttcaatgaaaaattc
ctagagtttattgaatttttacagatttcagactacaatcgaactgaagatcaagcataa
ttagcctcatttttgatcgataaaatgataattggggagaagtttgattataaaaagcaa
agcgatattaactacgttactgtattccagagatatagagaggacaaagaaaatgaaaat
gacttttgcagatctaagcaaagcataaatttcttaaggtagaggagattatttatctca
ccaacaatcgattactactagccagcttaagaggatgaaagtaatagagtcattaggaaa
tatcaagattatttatcaagatttgtgagagtttcatttgttaatgagtatcttgagaaa
ggcttttattttactgaaaatatggaatgggtcctaggttacattcatcatgtattatac
aatggtttgtagctgggcaagtatattcttagattccttagttactcgaattctcagatt
aaaaaccattcatgttggatgatagtcgaaactcttgattcaataacagaatttaatacc
taacttaatgagaatatgatcatgtcgagcatgggtaatttctcaaaggagtaaaatatt
ttgaaaagatatgctagaaggggttagtgcttctcaaccactaaatttattgtgaatctt
gataaacatgaagcttaactcggaatacctgacataaagcgaaatggattcgtgtttact
gatggctgcggatatatctctccttaattagctcaaattgtaagtgagcaatttggttat
aagagaaactcagcttttcaaataagattcggaggcgcgaaaggggttttgatgattaaa
ccagagttgaaaggtagaatggtttaaattagagacagttaaataaagtttcagagcaat
gattttggtcttaatgtagttagatgctcaacattcagctaaggattccttaatcgtcag
attataatactcttatctagcctcggagttaaagaagaagtattcctaagtctttaacaa
aaggctaaagaatatgctcaagtccaagaaatatataaaagcttaataaacaaaacgaaa
aaggcgattaaagcatacaagtaaagtcataataagaataggagtctaccttagatatca
caattaattaacttatcccttggcccaagtaaatggtttgaacaaactcttaaaatggca
ctactaactggatataatattcctaaggatcccattttcagtagtatactatacacaatg
cagttatcttcttacatgaatctaaagaaaaaggccaggattataataccaaattcgtgt
gtcctgttaggagtcattgatgagacaggtattcttgaggaaaatgaggtttattgctaa
atcaggccagataactactcccttaaaaggaagcaagcactttgggatctgtattctgat
gatagtgttgaggaaccgaaactagttaatggctcagtaattgtcacaaggaatccttgc
actcatccaggtgatataagattattagccgcagttgatagaccggaactagctcattta
ttcaatgtgatagtattttcttcaaaaggtgataggcctcaatgtaataaaatggcaggt
ggagatttagatggagatgtttactttgtttgctgggacaaaatgctacttgacaatata
gaccctaataacatcgaggagccagctaaatatgaaaagccctaattaataacagaataa
cctgcagatacttcgcatattgctgactactacatattttacttacaaagagacgttctt
ggcaagttggctaatatgcacctggctttatgtgattaaattggagtagatggacctctt
agaccagaatgtgaagagttgtctgcaatgcaagctgtcgcagttgatttcgctaagcat
ggtgaatgtgtgcctaaataaaactttgagcatcttagtaaattgcttgatgattggcca
gattttttcgagaagtccaatcaaaaagctagagtgagttaaggaattttggggaaacta
tacagagacataaacaacgagtcagctataagagactttatgaaaaatcaatttaagttc
taagttcttttccagtacgaactaaatcatcaaatattacaaaagtgctctaattttaag
cttctcaaccactacttgccaaaagtattcaaatcaatagtaaaaccaatggaagtacaa
ttcagataacttatgattacttttaagctgtaaagcgaagcctagcttttcgcttgcgac
ctcaagtttaaactatgcgatgagcagatgaataacttctataagaatgaacctggatac
aaatctgaggaatcactaatcattttaaacaataaaatcagtcaaattatcactaaattt
caggaaaagtttaagtctctagttaatgaggccagaaatgaaaagttcgacatgcaggct
gaggaaaacatagcagttgctctgtatctctgcacttactttcatactaacaatcaaagc
tgcaaagtttacttatctcagcatatagatgattaaaacttaatggaattcgtgacattg
tggaataactatgaaaaagagagaaggtcagatttgaagcccagctacatcgaaaagtat
aaaaagtttgagggctttgtggagatcagcagacaagtggagtcaagtaatgagtctagg
aaactgcaaaggttccttgaacttaggaagttcttctcatttccttggataattgcaagc
gatgtgctgttctcttagagggacttttaaattcatatctacaagtaaaagcatcagagc
taagagcaatga
>Contig5826.g6244(protein)
MENSNPNKYNTKESPQPRMKRSRSYCKVYSPVANHQIQLIPQIGTENLVPPLVFSPGKTD
EANLKLLSPKDNSATMYTKPHVDNQQQRQIDTSSNNEKEKNTKYMFDIVSDIIHFQVGTI
MYTKIKSDHQKENKKRFIPIFPFLYEDTNQGHNVNNCQFQMPNPPKAFINNGNANFISSE
ITNDNYADLKNEINQQKQEEEKKNSKIPTSDIPFKCQLRFQVEKDPFFMHEESRSTKIKA
HKKILESENPSPIYIVDLEFTNIKKIEIFLKEKKLQGGLYAEIYVHMDKPANCQKLYPFN
QMKPCFVRSPFKLPFDPYMQYWNLHQIYFIAGKVTNQKIDKFLEIVQKRNALVKVKITKQ
DYSEETNNDAKRSIIVSGLRTLIELNKKFKYIIDKLRLPIIFSMMAMLSNDKVNLFNEKF
LEFIEFLQISDYNRTEDQAQLASFLIDKMIIGEKFDYKKQSDINYVTVFQRYREDKENEN
DFCRSKQSINFLRQRRLFISPTIDYYQPAQEDESNRVIRKYQDYLSRFVRVSFVNEYLEK
GFYFTENMEWVLGYIHHVLYNGLQLGKYILRFLSYSNSQIKNHSCWMIVETLDSITEFNT
QLNENMIMSSMGNFSKEQNILKRYARRGQCFSTTKFIVNLDKHEAQLGIPDIKRNGFVFT
DGCGYISPQLAQIVSEQFGYKRNSAFQIRFGGAKGVLMIKPELKGRMVQIRDSQIKFQSN
DFGLNVVRCSTFSQGFLNRQIIILLSSLGVKEEVFLSLQQKAKEYAQVQEIYKSLINKTK
KAIKAYKQSHNKNRSLPQISQLINLSLGPSKWFEQTLKMALLTGYNIPKDPIFSSILYTM
QLSSYMNLKKKARIIIPNSCVLLGVIDETGILEENEVYCQIRPDNYSLKRKQALWDLYSD
DSVEEPKLVNGSVIVTRNPCTHPGDIRLLAAVDRPELAHLFNVIVFSSKGDRPQCNKMAG
GDLDGDVYFVCWDKMLLDNIDPNNIEEPAKYEKPQLITEQPADTSHIADYYIFYLQRDVL
GKLANMHLALCDQIGVDGPLRPECEELSAMQAVAVDFAKHGECVPKQNFEHLSKLLDDWP
DFFEKSNQKARVSQGILGKLYRDINNESAIRDFMKNQFKFQVLFQYELNHQILQKCSNFK
LLNHYLPKVFKSIVKPMEVQFRQLMITFKLQSEAQLFACDLKFKLCDEQMNNFYKNEPGY
KSEESLIILNNKISQIITKFQEKFKSLVNEARNEKFDMQAEENIAVALYLCTYFHTNNQS
CKVYLSQHIDDQNLMEFVTLWNNYEKERRSDLKPSYIEKYKKFEGFVEISRQVESSNESR
KLQRFLELRKFFSFPWIIASDVLFSQRDFQIHIYKQKHQSQEQ






>Contig5826.g6244(coding)
atggaaaattcaaaccctaataaatacaataccaaagaatcacctcaacctagaatgaag
agatctagatcgtactgcaaggtatactctcctgtcgctaatcattaaatatagttaata
ccttaaattgggactgaaaatttggtacctccacttgtgttctcccctggtaaaactgat
gaggcaaatttgaagttgcttagtcctaaggataactcagcaacaatgtatacaaaaccc
cacgttgataaccaataataaagatagattgatacctcgagcaataatgaaaaagaaaag
aatacaaagtacatgttcgacattgttagtgacattattcacttctaagttggcactatt
atgtacactaaaatcaaatcagatcactaaaaggagaataaaaaaagattcatacccata
ttccctttcttatatgaggatactaattaaggccacaatgttaacaattgctagttttaa
atgccgaatccacctaaagcatttattaataatggtaatgctaattttatatcatcagaa
attactaatgacaactatgctgacctgaaaaatgaaattaatcagcaaaagcaagaagaa
gagaagaaaaattctaaaatccccacttcagatattccttttaaatgccagctgagattt
taagtagaaaaagacccatttttcatgcatgaggagtctcgcagcactaagattaaagct
cataaaaagatattggagagtgaaaacccctctcctatatacattgtagatttagaattc
acaaacatcaagaagattgagatctttttgaaggaaaaaaaactttaaggaggtctctat
gcagagatatatgtacacatggataagccagcgaactgccagaaactttatccatttaat
taaatgaaaccttgctttgtgagatctccttttaaacttccttttgacccttacatgcaa
tattggaatttgcatcaaatttattttatagctgggaaagtaaccaactagaaaatcgat
aaatttcttgagattgtctagaaaagaaatgctttggtaaaagtcaaaataactaaataa
gattacagtgaggaaactaacaacgatgctaagagatctataatagtctctggactcaga
acattaatagaattgaacaagaagttcaagtatattattgataaactcagactgccgata
atattctcgatgatggcaatgctttcaaatgacaaagttaatttgttcaatgaaaaattc
ctagagtttattgaatttttacagatttcagactacaatcgaactgaagatcaagcataa
ttagcctcatttttgatcgataaaatgataattggggagaagtttgattataaaaagcaa
agcgatattaactacgttactgtattccagagatatagagaggacaaagaaaatgaaaat
gacttttgcagatctaagcaaagcataaatttcttaaggtagaggagattatttatctca
ccaacaatcgattactactagccagcttaagaggatgaaagtaatagagtcattaggaaa
tatcaagattatttatcaagatttgtgagagtttcatttgttaatgagtatcttgagaaa
ggcttttattttactgaaaatatggaatgggtcctaggttacattcatcatgtattatac
aatggtttgtagctgggcaagtatattcttagattccttagttactcgaattctcagatt
aaaaaccattcatgttggatgatagtcgaaactcttgattcaataacagaatttaatacc
taacttaatgagaatatgatcatgtcgagcatgggtaatttctcaaaggagtaaaatatt
ttgaaaagatatgctagaaggggttagtgcttctcaaccactaaatttattgtgaatctt
gataaacatgaagcttaactcggaatacctgacataaagcgaaatggattcgtgtttact
gatggctgcggatatatctctccttaattagctcaaattgtaagtgagcaatttggttat
aagagaaactcagcttttcaaataagattcggaggcgcgaaaggggttttgatgattaaa
ccagagttgaaaggtagaatggtttaaattagagacagttaaataaagtttcagagcaat
gattttggtcttaatgtagttagatgctcaacattcagctaaggattccttaatcgtcag
attataatactcttatctagcctcggagttaaagaagaagtattcctaagtctttaacaa
aaggctaaagaatatgctcaagtccaagaaatatataaaagcttaataaacaaaacgaaa
aaggcgattaaagcatacaagtaaagtcataataagaataggagtctaccttagatatca
caattaattaacttatcccttggcccaagtaaatggtttgaacaaactcttaaaatggca
ctactaactggatataatattcctaaggatcccattttcagtagtatactatacacaatg
cagttatcttcttacatgaatctaaagaaaaaggccaggattataataccaaattcgtgt
gtcctgttaggagtcattgatgagacaggtattcttgaggaaaatgaggtttattgctaa
atcaggccagataactactcccttaaaaggaagcaagcactttgggatctgtattctgat
gatagtgttgaggaaccgaaactagttaatggctcagtaattgtcacaaggaatccttgc
actcatccaggtgatataagattattagccgcagttgatagaccggaactagctcattta
ttcaatgtgatagtattttcttcaaaaggtgataggcctcaatgtaataaaatggcaggt
ggagatttagatggagatgtttactttgtttgctgggacaaaatgctacttgacaatata
gaccctaataacatcgaggagccagctaaatatgaaaagccctaattaataacagaataa
cctgcagatacttcgcatattgctgactactacatattttacttacaaagagacgttctt
ggcaagttggctaatatgcacctggctttatgtgattaaattggagtagatggacctctt
agaccagaatgtgaagagttgtctgcaatgcaagctgtcgcagttgatttcgctaagcat
ggtgaatgtgtgcctaaataaaactttgagcatcttagtaaattgcttgatgattggcca
gattttttcgagaagtccaatcaaaaagctagagtgagttaaggaattttggggaaacta
tacagagacataaacaacgagtcagctataagagactttatgaaaaatcaatttaagttc
taagttcttttccagtacgaactaaatcatcaaatattacaaaagtgctctaattttaag
cttctcaaccactacttgccaaaagtattcaaatcaatagtaaaaccaatggaagtacaa
ttcagataacttatgattacttttaagctgtaaagcgaagcctagcttttcgcttgcgac
ctcaagtttaaactatgcgatgagcagatgaataacttctataagaatgaacctggatac
aaatctgaggaatcactaatcattttaaacaataaaatcagtcaaattatcactaaattt
caggaaaagtttaagtctctagttaatgaggccagaaatgaaaagttcgacatgcaggct
gaggaaaacatagcagttgctctgtatctctgcacttactttcatactaacaatcaaagc
tgcaaagtttacttatctcagcatatagatgattaaaacttaatggaattcgtgacattg
tggaataactatgaaaaagagagaaggtcagatttgaagcccagctacatcgaaaagtat
aaaaagtttgagggctttgtggagatcagcagacaagtggagtcaagtaatgagtctagg
aaactgcaaaggttccttgaacttaggaagttcttctcatttccttggataattgcaagc
gatgtgctgttctcttagagggacttttaaattcatatctacaagtaaaagcatcagagc
taagagcaatga
>Contig5826.g6244(protein)
MENSNPNKYNTKESPQPRMKRSRSYCKVYSPVANHQIQLIPQIGTENLVPPLVFSPGKTD
EANLKLLSPKDNSATMYTKPHVDNQQQRQIDTSSNNEKEKNTKYMFDIVSDIIHFQVGTI
MYTKIKSDHQKENKKRFIPIFPFLYEDTNQGHNVNNCQFQMPNPPKAFINNGNANFISSE
ITNDNYADLKNEINQQKQEEEKKNSKIPTSDIPFKCQLRFQVEKDPFFMHEESRSTKIKA
HKKILESENPSPIYIVDLEFTNIKKIEIFLKEKKLQGGLYAEIYVHMDKPANCQKLYPFN
QMKPCFVRSPFKLPFDPYMQYWNLHQIYFIAGKVTNQKIDKFLEIVQKRNALVKVKITKQ
DYSEETNNDAKRSIIVSGLRTLIELNKKFKYIIDKLRLPIIFSMMAMLSNDKVNLFNEKF
LEFIEFLQISDYNRTEDQAQLASFLIDKMIIGEKFDYKKQSDINYVTVFQRYREDKENEN
DFCRSKQSINFLRQRRLFISPTIDYYQPAQEDESNRVIRKYQDYLSRFVRVSFVNEYLEK
GFYFTENMEWVLGYIHHVLYNGLQLGKYILRFLSYSNSQIKNHSCWMIVETLDSITEFNT
QLNENMIMSSMGNFSKEQNILKRYARRGQCFSTTKFIVNLDKHEAQLGIPDIKRNGFVFT
DGCGYISPQLAQIVSEQFGYKRNSAFQIRFGGAKGVLMIKPELKGRMVQIRDSQIKFQSN
DFGLNVVRCSTFSQGFLNRQIIILLSSLGVKEEVFLSLQQKAKEYAQVQEIYKSLINKTK
KAIKAYKQSHNKNRSLPQISQLINLSLGPSKWFEQTLKMALLTGYNIPKDPIFSSILYTM
QLSSYMNLKKKARIIIPNSCVLLGVIDETGILEENEVYCQIRPDNYSLKRKQALWDLYSD
DSVEEPKLVNGSVIVTRNPCTHPGDIRLLAAVDRPELAHLFNVIVFSSKGDRPQCNKMAG
GDLDGDVYFVCWDKMLLDNIDPNNIEEPAKYEKPQLITEQPADTSHIADYYIFYLQRDVL
GKLANMHLALCDQIGVDGPLRPECEELSAMQAVAVDFAKHGECVPKQNFEHLSKLLDDWP
DFFEKSNQKARVSQGILGKLYRDINNESAIRDFMKNQFKFQVLFQYELNHQILQKCSNFK
LLNHYLPKVFKSIVKPMEVQFRQLMITFKLQSEAQLFACDLKFKLCDEQMNNFYKNEPGY
KSEESLIILNNKISQIITKFQEKFKSLVNEARNEKFDMQAEENIAVALYLCTYFHTNNQS
CKVYLSQHIDDQNLMEFVTLWNNYEKERRSDLKPSYIEKYKKFEGFVEISRQVESSNESR
KLQRFLELRKFFSFPWIIASDVLFSQRDFQIHIYKQKHQSQEQ